מגוון ביולוגי ושימור ערכי טבע בחלק זה של האתר מוצגים מאמרים, דוחות מקצועיים וסקירות של חוקרי חיא"ל על המגוון הביולוגי ובתי הגידול בסביבה הימית של ישראל, בים התיכון ובמפרץ אילת, על ההשפעות של פעילות האדם על אוכלוסיות החי הימי, מהמפעלים ההנדסיים הגדולים של כריית תעלת סואץ והקמת סכר אסואן ועד לבנייה בחופים וזיהום הים, על מחקרים המכוונים לשימור ושיקום של ערכי טבע, וקישורים לאתרים רלוונטיים. בין ביולוגיה אקולוגיה לארכאולוגיה - מאמר על אוכלוסיות החי מזרח הים התיכון, השפעות פעילות האדם על המגוון הביולוגי ועוד משתלת אלמוגים במפרץ אילת – פיתוח שיטה לשיקום שוניות אלמוגים פגועות מידע ברחבי הרשת: אטלס מינים אקזוטיים בים התיכון - רשימות של מיני בע"ח שהיגרו לים התיכון מאזורים אחרים: כולל תיאור המינים, ביולוגיה ואקולוגיה, תפוצתה ועוד (באתר CIESM – הארגון למחקר הים התיכון)